2014年11月，21世纪教育研究院牵头成立农村小规模学校联盟，旨在为分散各地的农村小规模学校搭建交流与成长的平台，同时联合社会各级力量为农村学校发展提供支持，探索农村教育发展的方向和可能性。

农村小规模学校联盟，是服务乡镇及以下学生人数不足200的小规模学校的公益平台。截至2020年5月19日，联盟覆盖29个省份的1554所农村小规模学校，以及区域联盟及教师自组织14家。

联盟通过公益项目推介、线下线上培训、年会交流、小而美种子学校培育、区域自组织支持等多种形式支持农村小规模学校发展，通过传播倡导提升农村小规模教育质量的实践与理念，同时联合近50家公益机构、基金会以公益项目引介、公益培训等方式对农村小规模学校以直接支持。

2018年，农校小规模学校联盟加入好公益平台，做为枢纽组织以路演形式对接适合农村小规模学校的公益项目，批量对接给地方教育局所覆盖的学校。

农校小规模学校联盟曾获得《亲子天下》两岸三地“2019教育创新领袖”奖。